Prednostov krajských úradov by od budúceho roku mohla vymenúvať vláda na návrh premiéra, pričom prednostovia by mali pôsobiť ako zástupcovia vlády v území kraja. Odporúča to Projekt ďalšej decentralizácie verejnej správy na roky 2003 až 2006, ktorý vypracoval vládny splnomocnenec pre uvedenú problematiku Viktor Nižňanský. Nový krajský prednosta bude koordinovať činnosť špecializovaných orgánov štátnej správy, ktoré zriadia jednotlivé rezorty po zrušení okresných úradov. Rovnako bude spolupracovať so zástupcami samosprávy, teda s predsedom samosprávneho kraja, primátormi a so starostami. Prednosta by mal tiež niesť zodpovednosť vo veciach obrany štátu.